Decyzja o jego założeniu zapadła w 1966 r., a dwa lata później rozpoczęła się budowa parku etnograficznego.

Jako pierwsze do Wygiełzowa zostały przeniesione dwa zabytkowe obiekty: dom miejski z Chrzanowa z 1804 r. oraz spichlerz z Kościelca z 1798 r. Niedługo potem chałupa sołtysia z Przegini Duchownej z 1862 r. Te trzy budynki można było zwiedzać w 1973 r. a skansen był częścią powołanego w 1970 r. przy Muzeum w Chrzanowie oddziału „Ruiny Zamku Lipowiec - Park Etnograficzny".

Dopiero od 2007 r. powstała nowa, samodzielna instytucja kultury - Muzeum Nadwiślański Park Etnograficzny w Wygiełzowie i Zamek Lipowiec, która od ubiegłego roku nosi nową nazwę - Muzeum Małopolski Zachodniej w Wygiełzowie.